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针对我国基因组学数据“存管用”的实际需求以及“数据孤岛”、“数据主权”的重大问题，国家基因组科学数据中心（以下简称“中心”）围绕人、动物、植物、微生物基因组数据，重点开展数据资源及数据库体系建设，并开展数据服务、系统运维、技术研发、数据挖掘等系列工作。该中心依托中国科学院北京基因组研究所，联合中国科学院上海营养与健康研究所和中国科学院生物物理研究所共同建设，上级主管部门为科技部基础司和中国科学院。中心设立管理委员会、专家委员会和用户委员会，建立中心运行管理机制，实行主任负责制，全面负责运行和管理工作。中心组建70人左右的科学数据专业化团队，提供基因组学数据统一存储、整合挖掘、共享应用的一站式数据服务，成为有国际影响力的基因组科学数据中心。